Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- s -

• S : pwiz::proteome::PeptideDatabaseFormula
• Same() : pwiz::data::diff_impl::Same< object_type, config_type >
• SameDeep() : pwiz::data::diff_impl::SameDeep< object_type, config_type >
• sample() : pwiz::math::MatchedFilter::SampledData< space_type >
• Sample() : pwiz::identdata::Sample , pwiz::msdata::Sample
• sampled_data_type : pwiz::math::MatchedFilter::KernelTraits< Kernel >
• SampleDatum() : pwiz::data::SampleDatum< abscissa_type, ordinate_type >
• SampleEnzyme() : pwiz::data::pepxml::SampleEnzyme
• sampleEnzyme : pwiz::data::pepxml::MSMSRunSummary
• sampleIndex() : pwiz::math::MatchedFilter::SampledData< space_type >
• sampleList_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• sampleMapping_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• SampleMZ5() : pwiz::msdata::mz5::SampleMZ5
• samplePtr : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationItem , pwiz::msdata::Run
• samplePtrs : pwiz::msdata::MSData
• sampleRefID : pwiz::msdata::mz5::RunMZ5
• samples : pwiz::identdata::AnalysisSampleCollection , pwiz::math::MatchedFilter::SampledData< space_type >
• Samples : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• samples_type : pwiz::math::MatchedFilter::SampledData< space_type > , pwiz::math::MatchedFilter::KernelTraits< Kernel >
• SavitzkyGolaySmoother() : pwiz::analysis::SavitzkyGolaySmoother< T >
• saxstring() : pwiz::minimxml::SAXParser::saxstring
• scale() : pwiz::data::FrequencyData
• Scan : pwiz::identdata::Serializer_Text , pwiz::data::peakdata::Scan
• scan : pwiz::utility::MSIHandler::Record
• scanCount : RunHeaderStruct , pwiz::utility::MSIHandler::Record , pwiz::msdata::RAMPAdapter , pwiz_RAMPAdapter
• scanEvent : pwiz::msdata::SpectrumInfo
• scanEventSet_ : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanEventSet
• scanFirst : pwiz::utility::MSIHandler::Record
• scanLast : pwiz::utility::MSIHandler::Record
• scanList : pwiz::msdata::Spectrum , pwiz::msdata::mz5::ScansMZ5 , pwiz::msdata::mz5::SpectrumMZ5
• ScanListMZ5() : pwiz::msdata::mz5::ScanListMZ5
• ScanMZ5() : pwiz::msdata::mz5::ScanMZ5
• scanNumber : pwiz::data::peakdata::Scan , TestSpectrumInfo , pwiz::msdata::SpectrumInfo , pwiz::data::FrequencyData
• scanNumberRange : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::Config
• scanNumbers : pwiz::msdata::SpectrumIterator::Config
• scanNumberSet_ : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet
• scans : pwiz::data::peakdata::PeakData , pwiz::msdata::ScanList
• ScanSetting : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• scanSettingList_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• scanSettingMapping_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• ScanSettingMZ5() : pwiz::msdata::mz5::ScanSettingMZ5
• scanSettingRefID : pwiz::msdata::mz5::InstrumentConfigurationMZ5
• ScanSettings() : pwiz::msdata::ScanSettings
• scanSettingsPtr : pwiz::msdata::InstrumentConfiguration
• scanSettingsPtrs : pwiz::msdata::MSData
• ScansMZ5() : pwiz::msdata::mz5::ScansMZ5
• scanTimeHigh_ : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange
• scanTimeLow_ : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange
• scanType : ScanHeaderStruct
• ScanWindow() : pwiz::msdata::ScanWindow
• scanWindowList : pwiz::msdata::mz5::ScanMZ5
• scanWindows : pwiz::msdata::Scan
• Score : pwiz::identdata::Serializer_Text , pwiz::frequency::PeakDetectorMatchedFilter::Score
• score : pwiz::analysis::PrecursorRecalculator::PrecursorInfo , pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRefine::PrecursorInfo , pwiz::data::pepxml::Match , pwiz::data::peakdata::PeakFamily , pwiz::data::peakdata::Feature , pwiz::eharmony::DistanceAttribute , pwiz::eharmony::NumberOfMS2IDs , pwiz::eharmony::RandomDistance , pwiz::eharmony::RTDiffDistribution , pwiz::eharmony::HammingDistance , pwiz::eharmony::WeightedHammingDistance , pwiz::eharmony::EditDistance , pwiz::eharmony::SearchNeighborhoodCalculator , pwiz::eharmony::NormalDistributionSearch
• scoreMatrix : pwiz::eharmony::EditDistance
• ScoreType : pwiz::identdata::DelimReader , pwiz::identdata::Serializer_Text
• sd_peak_mz : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::Stats
• search_engine : pwiz::analysis::PepxmlRecordReader
• search_id : pwiz::data::pepxml::SearchSummary
• search_scores : pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record
• searchDatabase : pwiz::identdata::SpectrumIdentification , pwiz::identdata::Inputs , pwiz::data::pepxml::SearchSummary
• SearchDatabase() : pwiz::identdata::SearchDatabase , pwiz::data::pepxml::SearchDatabase
• searchDatabasePtr : pwiz::identdata::DBSequence
• searchEngine : pwiz::data::pepxml::SearchSummary
• searchHit : pwiz::data::pepxml::SearchResult
• SearchHit() : pwiz::data::pepxml::SearchHit
• searchId : pwiz::data::pepxml::SearchResult
• searchID : pwiz::data::pepxml::SearchSummary
• SearchModification() : pwiz::identdata::SearchModification
• searchNbhdCalculator : pwiz::data::pepxml::MatchData
• SearchNeighborhoodCalculator() : pwiz::eharmony::SearchNeighborhoodCalculator
• SearchResult() : pwiz::data::pepxml::SearchResult
• searchResult : pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery
• searchScore : pwiz::data::pepxml::SearchHit
• SearchScore() : pwiz::data::pepxml::SearchScore
• SearchSummary() : pwiz::data::pepxml::SearchSummary
• searchSummary : pwiz::data::pepxml::MSMSRunSummary
• searchType : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationProtocol
• second : Root
• SecondHandler() : SecondHandler
• secondHandler_ : RootHandler
• SecondIs() : pwiz::SecondIs< T >
• SelectedIndexPredicate() : SelectedIndexPredicate
• SelectedIon() : pwiz::msdata::SelectedIon
• selectedIonList : pwiz::msdata::mz5::PrecursorMZ5
• selectedIons : pwiz::msdata::Precursor
• sense : pwiz::identdata::PepXMLSpecificity , pwiz::data::pepxml::Specificity
• sensitivity : pwiz::data::pepxml::RocDataPoint
• seq : pwiz::identdata::DBSequence , pwiz::identdata::sequence_p , pwiz::identdata::seq_p , pwiz::identdata::dbsequence_p
• seq_p() : pwiz::identdata::seq_p
• seqNum : ScanHeaderStruct
• seqNumStart : ScanCacheStruct
• sequence : pwiz::peptideid::PeptideID::Record , TestPeptide , TestModifiedPeptide , TestFragmentation , pwiz::tradata::Protein , pwiz::tradata::Peptide , pwiz::proteome::IPIFASTADatabase::Record , pwiz::proteome::PeptideDatabase , pwiz::proteome::Peptide
• sequence_p() : pwiz::identdata::sequence_p
• sequenceCollection : pwiz::identdata::IdentData
• sequenceKey : pwiz::proteome::PeptideDatabaseRecord
• Serializer_FASTA() : pwiz::proteome::Serializer_FASTA
• Serializer_MGF() : pwiz::msdata::Serializer_MGF
• Serializer_MSn() : pwiz::msdata::Serializer_MSn
• Serializer_mz5() : pwiz::msdata::Serializer_mz5
• Serializer_mzIdentML() : pwiz::identdata::Serializer_mzIdentML
• Serializer_mzML() : pwiz::msdata::Serializer_mzML
• Serializer_mzXML() : pwiz::msdata::Serializer_mzXML
• Serializer_pepXML() : pwiz::identdata::Serializer_pepXML
• Serializer_protXML() : pwiz::identdata::Serializer_protXML
• Serializer_Text() : pwiz::identdata::Serializer_Text
• Serializer_traML() : pwiz::tradata::Serializer_traML
• set : pwiz::analysis::PepxmlRecordReader , pwiz::data::ParamContainer , pwiz::identdata::DelimReader , pwiz::minimxml::SAXParser::Handler::Attributes::attribute , pwiz::data::ParamContainer
• setCVRefMZ5() : pwiz::msdata::mz5::ReferenceRead_mz5
• setDataProcessingPtr() : pwiz::msdata::ChromatogramListBase , pwiz::msdata::SpectrumListBase
• setDebug() : pwiz::identdata::Pep2MzIdent
• setHandler() : pwiz::utility::TabReader
• setMode() : pwiz::msdata::MemoryMRUCache< PtrType, KeyExtractor > , pwiz::proteome::ProteinListCache
• setMS2LabeledFlag() : pwiz::eharmony::Feature_dataFetcher
• setMspa() : pwiz::identdata::Pep2MzIdent
• setMZIntensityArrays() : pwiz::msdata::Spectrum
• setMZIntensityPairs() : pwiz::msdata::Spectrum
• setParamMap() : pwiz::identdata::Pep2MzIdent
• setParserIndex() : pwiz::minimxml::SAXParser::Handler::Attributes
• setPattern() : pwiz::identdata::RegexCVMap
• SetRetentionTime() : SetRetentionTime
• setRtAdjustedFlag() : pwiz::eharmony::PeptideID_dataFetcher
• setTimeIntensityArrays() : pwiz::msdata::Chromatogram
• setTimeIntensityPairs() : pwiz::msdata::Chromatogram
• setTranslating() : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• setVerbose() : pwiz::identdata::Pep2MzIdent
• sha1_ : pwiz::util::SHA1SymmetricFilter
• SHA1_ostream() : pwiz::util::SHA1_ostream
• SHA1Calculator() : pwiz::util::SHA1Calculator
• sha1Calculator_ : pwiz::msdata::SHA1OutputObserver
• SHA1Filter() : pwiz::util::SHA1Filter
• shared_map() : pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
• shift() : pwiz::data::FrequencyData
• shortName() : pwiz::cv::CVTermInfo
• sieve : pwiz::msdata::SpectrumIterator::Config
• sigma : pwiz::eharmony::IslandizedDatabase::Gaussian
• simAsSpectra : pwiz::msdata::Reader::Config
• Simple() : Simple
• SimpleAnalyzer() : SimpleAnalyzer
• SimpleProgressCallback() : SimpleProgressCallback
• sinBx_ : ParametrizedCosine
• singlyChargedFraction : TestChargeStateCalculator
• siteRegexp : pwiz::identdata::Enzyme
• size() : MyBase , pwiz::msdata::SpectrumListWrapper , FilterWrapper , pwiz::proteome::ProteinListWrapper , FilterWrapper , pwiz::proteome::ProteinList , pwiz::proteome::ProteinListSimple , pwiz::msdata::detail::ChromatogramList_ABI , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI_T2D , pwiz::msdata::detail::ChromatogramList_Agilent , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::msdata::detail::ChromatogramList_Bruker , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Bruker , pwiz::msdata::detail::ChromatogramList_Thermo , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo , pwiz::msdata::detail::ChromatogramList_Waters , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Waters , pwiz::math::OrderedPairContainerRef , pwiz::util::CharIndexedVector< T > , pwiz::util::IntegerSet , pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor > , pwiz::utility::MSIHandler , pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , ScanCacheStruct , pwiz::minimxml::SAXParser::Handler::Attributes , auto_vector< T > , pwiz::calibration::MassDatabase , pwiz::proteome::PeptideDatabase , pwiz::analysis::ChromatogramListWrapper , pwiz::Bin< T > , pwiz::eharmony::PeptideID_dataFetcher , pwiz::analysis::ProteinList_DecoyGenerator , pwiz::analysis::ProteinList_Filter , pwiz::analysis::SpectrumList_Filter , pwiz::analysis::SpectrumList_Sorter , pwiz::data::BinaryIndexStream , pwiz::data::Index , pwiz::data::MemoryIndex , MyBase , pwiz::msdata::SpectrumList , pwiz::msdata::SpectrumListSimple , pwiz::msdata::ChromatogramList , pwiz::msdata::ChromatogramListSimple
• size_type : pwiz::util::CharIndexedVectorIterator< T > , pwiz::util::CharIndexedVectorConstIterator< T > , pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
• sizeInDbEntries : pwiz::data::pepxml::SearchDatabase
• sizeOfResidues : pwiz::data::pepxml::SearchDatabase
• SLP_InitializeAllOnCreation : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• SLP_InitializeAllOnFirstCall : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• smooth() : pwiz::analysis::SavitzkyGolaySmoother< T > , pwiz::analysis::Smoother , pwiz::analysis::WhittakerSmoother
• smooth_copy() : pwiz::analysis::SavitzkyGolaySmoother< T > , pwiz::analysis::Smoother , pwiz::analysis::WhittakerSmoother
• Software() : pwiz::msdata::Software
• software : pwiz::data::peakdata::PeakData
• Software : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5 , pwiz::data::peakdata::Software , pwiz::msdata::Software , pwiz::tradata::Software
• software_p() : pwiz::identdata::software_p
• softwareList_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• softwareMapping_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• SoftwareMZ5() : pwiz::msdata::mz5::SoftwareMZ5
• softwareName : pwiz::identdata::AnalysisSoftware
• softwarePtr : pwiz::msdata::InstrumentConfiguration , pwiz::tradata::RetentionTime , pwiz::tradata::Prediction , pwiz::msdata::ProcessingMethod
• softwarePtrs : pwiz::msdata::MSData , pwiz::tradata::TraData
• softwareRefID : pwiz::msdata::mz5::InstrumentConfigurationMZ5 , pwiz::msdata::mz5::ProcessingMethodMZ5
• solve() : pwiz::math::LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_LU > , pwiz::math::LinearSolver< LinearSolverType_LU > , pwiz::math::LinearSolver< LinearSolverType_QR > , pwiz::math::LinearLeastSquares< LinearLeastSquaresType_QR >
• sort : pwiz::identdata::Serializer_Text::Config
• SortBy : pwiz::analysis::PrecursorRecalculatorDefault::Config
• sortBy : pwiz::analysis::PrecursorRecalculatorDefault::Config
• SortBy_Proximity : pwiz::analysis::PrecursorRecalculatorDefault::Config
• SortBy_Score : pwiz::analysis::PrecursorRecalculatorDefault::Config
• source : pwiz::data::peakdata::Software , pwiz::msdata::ComponentList
• SourceFile() : pwiz::msdata::SourceFile
• sourceFile : pwiz::identdata::Inputs
• sourceFileIDs : pwiz::msdata::mz5::ScanSettingMZ5
• sourceFileList_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• sourceFileMapping_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• SourceFileMZ5() : pwiz::msdata::mz5::SourceFileMZ5
• sourceFilename : pwiz::analysis::MSDataAnalyzer::DataInfo , pwiz::data::peakdata::PeakData
• sourceFilePosition : pwiz::msdata::SpectrumIdentity , pwiz::msdata::ChromatogramIdentity
• sourceFilePositionForBinarySpectrumData : pwiz::msdata::SpectrumIdentityFromXML
• sourceFilePtr : pwiz::msdata::Precursor , pwiz::msdata::Scan , pwiz::msdata::Spectrum
• sourceFilePtrs : pwiz::msdata::ScanSettings , pwiz::msdata::FileDescription
• sourceFileRefID : pwiz::msdata::mz5::RunMZ5 , pwiz::msdata::mz5::PrecursorMZ5 , pwiz::msdata::mz5::ScanMZ5 , pwiz::msdata::mz5::SpectrumMZ5
• SourceFiles : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• sources : pwiz::msdata::mz5::ComponentsMZ5
• sowPeak() : pwiz::analysis::PeakelGrower , pwiz::analysis::PeakelGrower_Proximity
• sowPeaks() : pwiz::analysis::PeakelGrower
• space_type : pwiz::math::MatchedFilter::KernelTraitsBase< Kernel > , pwiz::math::MatchedFilter::KernelTraits< Kernel > , OneMinusAbs , pwiz::math::MatchedFilter::KernelTraitsBase< Y(*)(X)>
• Specificity() : pwiz::data::pepxml::Specificity
• specificity : pwiz::data::pepxml::SampleEnzyme
• specificityRules : pwiz::identdata::SearchModification
• specificTermini() : pwiz::proteome::DigestedPeptide
• spectra : pwiz::msdata::SpectrumListSimple
• SpectraData() : pwiz::identdata::SpectraData
• spectraData : pwiz::identdata::Inputs
• spectraDataPtr : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationResult
• spectralCount : pwiz::eharmony::Observation
• spectrum() : pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI
• Spectrum() : pwiz::msdata::Spectrum
• spectrum() : pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Bruker , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::analysis::SpectrumList_MetadataFixer , pwiz::analysis::SpectrumList_MZWindow , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo , pwiz::analysis::SpectrumList_PeakFilter , pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRecalculator , pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRefine , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::analysis::SpectrumList_Smoother , pwiz::msdata::SpectrumListCache , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI , MyWrapper , pwiz::analysis::SpectrumList_TitleMaker , pwiz::analysis::SpectrumList_ZeroSamplesFilter , pwiz::msdata::SpectrumList , pwiz::msdata::SpectrumListSimple , MyBase , FilterWrapper , pwiz::msdata::SpectrumListWrapper , pwiz::analysis::SpectrumList_Sorter , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI_T2D , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::msdata::SpectrumList , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Waters , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo , pwiz::analysis::SpectrumList_Filter , pwiz::analysis::SpectrumList_PeakPicker , pwiz::analysis::SpectrumList_ChargeStateCalculator , pwiz::analysis::SpectrumList_Filter , pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Waters , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Bruker
• SpectrumBinaryData() : pwiz::analysis::SpectrumBinaryData
• SpectrumBinaryMetaData : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• spectrumCache() : pwiz::msdata::SpectrumListCache
• spectrumCache_ : pwiz::msdata::SpectrumListCache
• spectrumCount() : pwiz::msdata::Index_mzML
• spectrumID : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationResult , pwiz::msdata::Precursor , pwiz::msdata::Scan
• SpectrumIdentification() : pwiz::identdata::SpectrumIdentification
• spectrumIdentification : pwiz::identdata::AnalysisCollection
• SpectrumIdentificationItem() : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationItem
• spectrumIdentificationItem : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationResult
• spectrumIdentificationItemPtr : pwiz::identdata::PeptideHypothesis
• spectrumIdentificationList : pwiz::identdata::AnalysisData
• SpectrumIdentificationList() : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationList
• spectrumIdentificationListPtr : pwiz::identdata::SpectrumIdentification
• SpectrumIdentificationProtocol() : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationProtocol
• spectrumIdentificationProtocol : pwiz::identdata::AnalysisProtocolCollection
• spectrumIdentificationProtocolPtr : pwiz::identdata::SpectrumIdentification
• SpectrumIdentificationResult() : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationResult
• spectrumIdentificationResult : pwiz::identdata::SpectrumIdentificationList
• spectrumIdentity() : pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_ABI_T2D , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Waters , pwiz::msdata::SpectrumList , pwiz::analysis::SpectrumList_Sorter , FilterWrapper , MyBase , pwiz::msdata::SpectrumListSimple , pwiz::msdata::Index_mzML , pwiz::msdata::SpectrumListWrapper , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Agilent , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Bruker , pwiz::msdata::detail::SpectrumList_Thermo
• SpectrumIdentity() : pwiz::msdata::SpectrumIdentity
• spectrumIdentity() : pwiz::analysis::SpectrumList_Filter
• SpectrumIdentityFromMzXML() : pwiz::msdata::SpectrumIdentityFromMzXML
• SpectrumIdentityFromXML() : pwiz::msdata::SpectrumIdentityFromXML
• spectrumIDFormat : pwiz::identdata::SpectraData
• SpectrumIndex : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• spectrumIndex_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceRead_mz5
• SpectrumInfo() : pwiz::msdata::SpectrumInfo
• spectrumInfo() : pwiz::analysis::MSDataCache
• SpectrumInfo() : pwiz::msdata::SpectrumInfo
• SpectrumIntensity : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• SpectrumIterator() : pwiz::msdata::SpectrumIterator
• SpectrumList_ChargeStateCalculator() : pwiz::analysis::SpectrumList_ChargeStateCalculator
• SpectrumList_Filter() : pwiz::analysis::SpectrumList_Filter
• SpectrumList_FilterPredicate_ActivationType() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ActivationType
• SpectrumList_FilterPredicate_AnalyzerType() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_AnalyzerType
• SpectrumList_FilterPredicate_DefaultArrayLengthSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_DefaultArrayLengthSet
• SpectrumList_FilterPredicate_IndexSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_IndexSet
• SpectrumList_FilterPredicate_MSLevelSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_MSLevelSet
• SpectrumList_FilterPredicate_Polarity() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_Polarity
• SpectrumList_FilterPredicate_PrecursorMzSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_PrecursorMzSet
• SpectrumList_FilterPredicate_ScanEventSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanEventSet
• SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet
• SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange() : pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanTimeRange
• SpectrumList_MetadataFixer() : pwiz::analysis::SpectrumList_MetadataFixer
• SpectrumList_MZWindow() : pwiz::analysis::SpectrumList_MZWindow
• SpectrumList_PeakFilter() : pwiz::analysis::SpectrumList_PeakFilter
• SpectrumList_PeakPicker() : pwiz::analysis::SpectrumList_PeakPicker
• SpectrumList_PrecursorRecalculator() : pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRecalculator
• SpectrumList_PrecursorRefine() : pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRefine
• SpectrumList_Smoother() : pwiz::analysis::SpectrumList_Smoother
• SpectrumList_Sorter() : pwiz::analysis::SpectrumList_Sorter
• SpectrumList_TitleMaker() : pwiz::analysis::SpectrumList_TitleMaker
• SpectrumList_ZeroSamplesFilter() : pwiz::analysis::SpectrumList_ZeroSamplesFilter
• SpectrumListCache() : pwiz::msdata::SpectrumListCache
• spectrumListPtr : pwiz::msdata::Run
• SpectrumListWrapper() : pwiz::msdata::SpectrumListWrapper
• SpectrumLoadPolicy : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• spectrumLoadPolicy_ : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• spectrumMapping_ : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• SpectrumMetaData : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• SpectrumMZ : pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
• SpectrumMZ5() : pwiz::msdata::mz5::SpectrumMZ5
• spectrumQueries : pwiz::data::pepxml::MSMSRunSummary , pwiz::eharmony::IslandizedDatabase::Island
• spectrumQuery : pwiz::data::pepxml::Match
• SpectrumQuery() : pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery
• spectrumRefID : pwiz::msdata::mz5::ScanMZ5 , pwiz::msdata::mz5::PrecursorMZ5
• spectrumStats() : pwiz::analysis::RegionAnalyzer
• SpectrumStats() : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::SpectrumStats
• SpectrumTable() : pwiz::analysis::SpectrumTable
• SplineWarpFunction() : pwiz::eharmony::SplineWarpFunction
• spotID : pwiz::msdata::mz5::SpectrumMZ5 , pwiz::msdata::SpectrumIdentity
• sprank : pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record
• spscore : pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record
• square : pwiz::analysis::Pseudo2DGel
• srmAsSpectra : pwiz::msdata::Reader::Config
• standardDeviation : pwiz::analysis::Noise
• start : pwiz::identdata::PeptideEvidence , pwiz::analysis::Peak
• start_ : pwiz::util::Timer
• startElement() : FifthHandler , FirstHandler , pwiz::data::peakdata::HandlerFeature , RootHandler , pwiz::data::peakdata::HandlerPeak , pwiz::data::peakdata::HandlerPeakel , pwiz::minimxml::XMLWriter , pwiz::minimxml::SAXParser::Handler , SecondHandler , PrintEventHandler , AnotherRootHandler
• startMZ : RunHeaderStruct
• starts_with() : pwiz::minimxml::SAXParser::saxstring
• startScan : pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery
• startTimeStamp : pwiz::msdata::Run , pwiz::msdata::mz5::RunMZ5
• State() : pwiz::calibration::CalibratorTrial::State
• Stats() : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::Stats , pwiz::math::Stats
• stats() : pwiz::analysis::RegionAnalyzer
• Status() : pwiz::minimxml::SAXParser::Handler::Status , pwiz::util::IterationListener
• Status_Cancel : pwiz::util::IterationListener
• Status_Ok : pwiz::util::IterationListener
• stop : pwiz::analysis::Peak
• str() : pwiz::analysis::Version , pwiz::tradata::Version , pwiz::msdata::Version , pwiz::Version , pwiz::proteome::Version , pwiz::identdata::Version
• stream_offset : pwiz::minimxml::SAXParser::Handler , pwiz::data::Index , pwiz::minimxml::XMLWriter
• string() : pwiz::util::Image
• StringMatchCVMap() : pwiz::identdata::StringMatchCVMap
• stringUp() : pwiz::util::Image
• subSamples : pwiz::identdata::Sample
• substitutionModification : pwiz::identdata::Peptide
• SubstitutionModification() : pwiz::identdata::SubstitutionModification
• suggestedDetailLevel() : pwiz::analysis::SpectrumList_Filter::Predicate , HasBinaryDataPredicate
• sum_peak_intensity : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::Stats
• sum_sumIntensity : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::Stats
• sumAmplitude() : pwiz::data::peakdata::PeakFamily
• sumArea() : pwiz::data::peakdata::PeakFamily
• sumIntensity : pwiz::analysis::RegionAnalyzer::SpectrumStats
• summaryXML : pwiz::data::pepxml::MSMSPipelineAnalysis
• sumProbabilityOverMass() : pwiz::calibration::MassSpread
• sumProbabilityOverMass2() : pwiz::calibration::MassSpread
• sumSquares() : pwiz::data::FrequencyData
• sumSquaresModel() : pwiz::frequency::TruncatedLorentzianEstimator
• swap() : pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::proteome::ModificationMap , auto_vector< T > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
• symbol : pwiz::proteome::AminoAcid::Info::Record , pwiz::chemistry::Element::Info::Record , pwiz::chemistry::detail::Element , pwiz::data::pepxml::AminoAcidModification , TestAminoAcid