Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- e -
- e2
: pwiz::math::MatchedFilter::Correlation< Y >
- e_
: pwiz::frequency::DerivativeTest::AdaptedErrorFunction< value_type >
, pwiz::frequency::DerivativeTest::AdaptedErrorDerivative< value_type >
- eCompressionType
: pwiz::util::random_access_compressed_ifstream
- EditDistance()
: pwiz::eharmony::EditDistance
- editor
: pwiz::identdata::BibliographicReference
- elapsed()
: pwiz::util::Timer
- empty()
: pwiz::analysis::ChromatogramListWrapper
, pwiz::identdata::BibliographicReference
, pwiz::identdata::Enzymes
, pwiz::msdata::Sample
, pwiz::msdata::Component
, pwiz::identdata::Residue
, pwiz::msdata::Software
, pwiz::msdata::ScanSettings
, pwiz::identdata::Contact
, pwiz::identdata::AmbiguousResidue
, pwiz::msdata::InstrumentConfiguration
, pwiz::msdata::ProcessingMethod
, pwiz::identdata::MassTable
, pwiz::msdata::DataProcessing
, pwiz::msdata::Precursor
, pwiz::cv::CV
, pwiz::identdata::Organization
, pwiz::identdata::Filter
, pwiz::msdata::Product
, pwiz::msdata::Scan
, pwiz::identdata::DatabaseTranslation
, pwiz::msdata::ScanList
, pwiz::msdata::BinaryDataArray
, pwiz::identdata::Person
, pwiz::identdata::SpectrumIdentificationProtocol
, pwiz::msdata::Spectrum
, pwiz::msdata::Chromatogram
, pwiz::identdata::Measure
, pwiz::msdata::SpectrumList
, pwiz::msdata::SpectrumListSimple
, pwiz::data::CVParam
, pwiz::identdata::ContactRole
, pwiz::identdata::FragmentArray
, pwiz::msdata::ChromatogramList
, pwiz::msdata::ChromatogramListSimple
, pwiz::identdata::IonType
, pwiz::msdata::Run
, pwiz::msdata::MSData
, pwiz::identdata::Sample
, pwiz::identdata::PeptideEvidence
, pwiz::msdata::mz5::ParamListMZ5
, pwiz::msdata::mz5::BinaryDataMZ5
, pwiz::identdata::SequenceCollection
, pwiz::msdata::SpectrumListWrapper
, pwiz::proteome::Protein
, pwiz::data::UserParam
, pwiz::identdata::AnalysisSoftware
, pwiz::identdata::SpectrumIdentificationItem
, pwiz::proteome::ProteinList
, pwiz::proteome::ProteinListSimple
, pwiz::identdata::SpectraData
, pwiz::proteome::ProteomeData
, pwiz::tradata::Contact
, pwiz::identdata::Provider
, pwiz::identdata::SpectrumIdentificationResult
, pwiz::tradata::Publication
, pwiz::tradata::Software
, pwiz::identdata::SpectrumIdentificationList
, pwiz::tradata::RetentionTime
, pwiz::tradata::Prediction
, pwiz::data::ParamContainer
, pwiz::identdata::AnalysisSampleCollection
, pwiz::identdata::SpectrumIdentification
, pwiz::tradata::Evidence
, pwiz::tradata::Validation
, pwiz::identdata::ProteinDetectionProtocol
, pwiz::tradata::Instrument
, pwiz::tradata::Configuration
, pwiz::identdata::SearchDatabase
, pwiz::identdata::PeptideHypothesis
, pwiz::tradata::Interpretation
, pwiz::tradata::Protein
, pwiz::identdata::ProteinDetectionHypothesis
, pwiz::tradata::Modification
, pwiz::tradata::Peptide
, pwiz::data::ParamGroup
, pwiz::identdata::DBSequence
, pwiz::identdata::ProteinAmbiguityGroup
, pwiz::tradata::Compound
, pwiz::tradata::Precursor
, pwiz::identdata::ProteinDetectionList
, pwiz::tradata::Product
, pwiz::tradata::Transition
, pwiz::identdata::Modification
, pwiz::identdata::ProteinDetection
, pwiz::tradata::Target
, pwiz::tradata::TargetList
, pwiz::identdata::AnalysisCollection
, pwiz::tradata::TraData
, pwiz::util::IntegerSet
, pwiz::identdata::Identifiable
, pwiz::identdata::SubstitutionModification
, pwiz::identdata::AnalysisProtocolCollection
, pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor >
, pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::identdata::SourceFile
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::identdata::Peptide
, pwiz::identdata::Inputs
, pwiz::identdata::AnalysisData
, pwiz::identdata::IdentifiableParamContainer
, pwiz::identdata::SearchModification
, pwiz::identdata::DataCollection
, pwiz::identdata::IdentData
, pwiz::identdata::Enzyme
, pwiz::msdata::SourceFile
, pwiz::msdata::FileDescription
- EMPTY_CHUNK_SIZE
: pwiz::msdata::mz5::Configuration_mz5
- EmptyElement
: pwiz::minimxml::XMLWriter
- EmptyElementTag
: pwiz::minimxml::XMLWriter
- encode()
: pwiz::msdata::BinaryDataEncoder
- end()
: pwiz::peptideid::PeptideID
, pwiz::peptideid::PeptideID_flat
, pwiz::analysis::PepxmlRecordReader
, pwiz::peptideid::PeptideID_pepXml
, pwiz::peptideid::PeptideIDMap
, auto_vector< T >
, pwiz::proteome::Digestion
, pwiz::proteome::ModificationMap
, pwiz::math::OrderedPairContainerRef
, pwiz::util::CharIndexedVector< T >
, pwiz::util::IntegerSet
, pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor >
, pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::proteome::IPIFASTADatabase
, pwiz::minimxml::SAXParser::Handler::Attributes
, pwiz::utility::VectorTabHandler
, pwiz::analysis::SpectrumBinaryData::Config
, pwiz::identdata::PeptideEvidence
, pwiz::util::IntegerSet::Interval
, auto_vector< T >
, pwiz::proteome::PeptideDatabase
, pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor >
- end_
: pwiz::math::OrderedPairContainerRef
, pwiz::util::IntegerSet::Iterator
- endElement()
: pwiz::minimxml::SAXParser::Handler
, PrintEventHandler
, FifthHandler
, NestedHandler
, pwiz::minimxml::XMLWriter
, FirstHandler
- endMZ
: RunHeaderStruct
- ends_with()
: pwiz::minimxml::SAXParser::saxstring
- endScan
: pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery
- Entry()
: pwiz::calibration::MassDatabase::Entry
- entry()
: pwiz::calibration::MassDatabase
- EntryPtr
: pwiz::data::Index
- enzymaticSearchConstraint
: pwiz::data::pepxml::SearchSummary
- EnzymaticSearchConstraint()
: pwiz::data::pepxml::EnzymaticSearchConstraint
- enzyme
: pwiz::data::pepxml::EnzymaticSearchConstraint
- Enzyme()
: pwiz::identdata::Enzyme
- enzymeName
: pwiz::identdata::Enzyme
- enzymes
: pwiz::identdata::Enzymes
, pwiz::identdata::SpectrumIdentificationProtocol
- eos_
: pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_ScanNumberSet
, pwiz::analysis::ProteinList_FilterPredicate_IndexSet
, pwiz::analysis::SpectrumList_FilterPredicate_IndexSet
- epsilon()
: pwiz::peptideid::MSInspectRecordBuilder
, pwiz::peptideid::FlatRecordBuilder
- equal()
: pwiz::peptideid::PeptideID::IteratorInternal
, pwiz::peptideid::PeptideID::Iterator
- equal_range()
: pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::proteome::ModificationMap
- erase()
: pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::Bin< T >
, pwiz::eharmony::Feature_dataFetcher
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::proteome::ModificationMap
, pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::proteome::ModificationMap
, auto_vector< T >
, pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
, pwiz::eharmony::PeptideID_dataFetcher
, auto_vector< T >
, pwiz::util::CharIndexedVector< T >
, pwiz::proteome::ModificationMap
- error()
: pwiz::calibration::LeastSquaresCalibrator
, pwiz::calibration::MassSpread
, pwiz::data::pepxml::ErrorPoint
, pwiz::data::peakdata::Peak
, pwiz::data::pepxml::RocDataPoint
, pwiz::proteome::ReaderFail
, pwiz::calibration::ErrorEstimator
, pwiz::data::peakdata::Feature
, pwiz::frequency::TruncatedLorentzianEstimator
, pwiz::identdata::ReaderFail
, pwiz::msdata::ReaderFail
, pwiz::calibration::Calibrator
, pwiz::frequency::ParameterEstimator
, pwiz::tradata::ReaderFail
- error_
: pwiz::msdata::ReaderFail
, pwiz::proteome::ReaderFail
, pwiz::tradata::ReaderFail
, pwiz::identdata::ReaderFail
- error_point
: pwiz::data::pepxml::PeptideProphetSummary
- errorCalibration
: pwiz::calibration::CalibratorTrial::State
- errorEstimate
: pwiz::calibration::CalibratorTrial::State
- errorEstimatorIterationCount
: pwiz::calibration::CalibratorTrial::Configuration
- ErrorFunction()
: pwiz::frequency::ParametrizedFunction< value_type >::ErrorFunction
- errorTrue
: pwiz::calibration::CalibratorTrial::State
- escaped_attribute
: First
- est_tot_correct
: pwiz::data::pepxml::MixtureModel
- est_tot_num_correct
: pwiz::data::pepxml::PeptideProphetSummary
- estimate()
: pwiz::frequency::ParameterEstimator
, pwiz::frequency::FrequencyEstimator
, pwiz::frequency::ParameterEstimator
, pwiz::frequency::FrequencyEstimatorPhysicalModel
, pwiz::frequency::FrequencyEstimatorSimple
- evidence
: pwiz::tradata::Peptide
- exactSynonyms
: pwiz::data::Term
, pwiz::cv::CVTermInfo
- exception
: ThreadStatus
, TestModifiedPeptide
- exclude
: pwiz::identdata::Filter
- expect
: pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record
- experimentalMassToCharge
: pwiz::identdata::SpectrumIdentificationItem
- explicitFlush()
: pwiz::util::SHA1_ostream
- Exporter()
: pwiz::eharmony::Exporter
- extendAndWrite1DDataSet()
: pwiz::msdata::mz5::Connection_mz5
- extendData()
: pwiz::msdata::mz5::Connection_mz5
- ExtendedReaderList()
: pwiz::msdata::ExtendedReaderList
- extension()
: pwiz::msaux::Path
- externalFormatDocumentation
: pwiz::identdata::SourceFile
, pwiz::identdata::SpectraData
- externalSpectrumID
: pwiz::msdata::Scan
, pwiz::msdata::Precursor
- externalSpectrumId
: pwiz::msdata::mz5::PrecursorMZ5
- externalSpectrumID
: pwiz::msdata::mz5::ScanMZ5
- extractPeaks()
: pwiz::analysis::PeakExtractor