- r -

• RAMPAdapter() : pwiz::msdata::RAMPAdapter
• random_access_compressed_ifstream() : pwiz::util::random_access_compressed_ifstream
• range() : pwiz::calibration::MassDatabase
• rbegin() : pwiz::proteome::ModificationMap , pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor > , pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , auto_vector< T > , pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , auto_vector< T > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
• read() : pwiz::eharmony::Observation , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::pepxml::MSMSRunSummary , Reader1 , pwiz::data::pepxml::MSMSPipelineAnalysis , Reader2 , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::pepxml::Match , pwiz::tradata::Serializer_traML , pwiz::msdata::Reader_ABI , pwiz::data::pepxml::MatchData , pwiz::msdata::Reader_ABI , pwiz::msdata::Reader_ABI_T2D , pwiz::eharmony::ModificationStateEntry , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::peakdata::Peak , pwiz::msdata::Reader_ABI_T2D , pwiz::msdata::Reader_Agilent , pwiz::data::peakdata::PeakFamily , pwiz::msdata::Reader_Agilent , pwiz::msdata::Reader_Bruker , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::peakdata::Scan , pwiz::msdata::Reader_Bruker , pwiz::msdata::Reader_Thermo , pwiz::data::peakdata::Software::Parameter , pwiz::msdata::Reader_Thermo , pwiz::msdata::Reader_Waters , pwiz::eharmony::PeptideEntry , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::peakdata::Software , pwiz::msdata::Reader_Waters , pwiz::minimxml::basic_charcounter< Ch > , pwiz::data::peakdata::PeakData , Reader1 , pwiz::data::peakdata::Peakel , pwiz::data::peakdata::Feature , pwiz::eharmony::MSIAMTData , Reader1 , pwiz::data::peakdata::FeatureFile , pwiz::msdata::Reader_mzML , Reader2 , pwiz::msdata::Reader_mzML , pwiz::msdata::Reader_mzXML , pwiz::identdata::DelimReader , Reader2 , pwiz::msdata::Reader_mzXML , pwiz::msdata::Reader_MGF , pwiz::identdata::Serializer_mzIdentML , pwiz::msdata::Reader_MGF , pwiz::msdata::Reader_MSn , pwiz::identdata::DelimReader , pwiz::identdata::Serializer_pepXML , pwiz::msdata::Reader_MSn , pwiz::msdata::Reader_BTDX , pwiz::identdata::Serializer_protXML , pwiz::msdata::Reader_BTDX , pwiz::msdata::Reader_mz5 , pwiz::identdata::DelimReader , pwiz::identdata::Serializer_Text , pwiz::msdata::Reader_mz5 , TestReader , pwiz::data::FrequencyData , TestReader , pwiz::msdata::mz5::SourceFileMZ5 , pwiz::identdata::MascotReader , pwiz::data::FrequencyData , pwiz::msdata::mz5::SampleMZ5 , pwiz::msdata::mz5::SoftwareMZ5 , pwiz::data::pepxml::Specificity , pwiz::msdata::mz5::ScanSettingMZ5 , pwiz::msdata::mz5::InstrumentConfigurationMZ5 , pwiz::identdata::MascotReader , pwiz::data::pepxml::SampleEnzyme , pwiz::msdata::mz5::DataProcessingMZ5 , pwiz::msdata::Reader , pwiz::data::pepxml::SearchDatabase , pwiz::msdata::Reader , pwiz::msdata::ReaderList , pwiz::identdata::MascotReader , pwiz::data::pepxml::Q3RatioResult , pwiz::msdata::ReaderList , pwiz::data::pepxml::PeptideProphetResult , pwiz::msdata::ReaderList , Reader1 , pwiz::identdata::Reader , pwiz::data::pepxml::AnalysisResult , Reader1 , Reader2 , pwiz::data::pepxml::AlternativeProtein , Reader2 , pwiz::msdata::Serializer_MGF , pwiz::identdata::Reader , pwiz::data::pepxml::ModAminoAcidMass , pwiz::msdata::Serializer_MSn , pwiz::msdata::Serializer_mz5 , pwiz::data::pepxml::ModificationInfo , pwiz::msdata::Serializer_mz5 , pwiz::msdata::Serializer_mzML , pwiz::identdata::Reader , pwiz::data::pepxml::Parameter , pwiz::msdata::Serializer_mzXML , TestReader , pwiz::data::pepxml::SearchScore , pwiz::proteome::Reader , pwiz::identdata::Reader , pwiz::data::pepxml::SearchHit , pwiz::proteome::ReaderList , pwiz::data::pepxml::SearchResult , pwiz::proteome::Reader_FASTA , Reader1 , pwiz::eharmony::AMTContainer , pwiz::identdata::Reader , pwiz::data::pepxml::EnzymaticSearchConstraint , Reader2 , pwiz::tradata::ReaderList , pwiz::proteome::Serializer_FASTA , pwiz::data::pepxml::AminoAcidModification , pwiz::tradata::Reader , pwiz::identdata::ReaderList , pwiz::data::pepxml::SearchSummary , pwiz::data::pepxml::SpectrumQuery
• readAndWriteChromatograms() : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• readAndWriteSpectra() : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• readDataSet() : pwiz::msdata::mz5::Connection_mz5
• Reader_FASTA() : pwiz::proteome::Reader_FASTA
• ReaderConfig() : Reader1::ReaderConfig , Reader2::ReaderConfig
• ReaderFail() : pwiz::identdata::ReaderFail , pwiz::msdata::ReaderFail , pwiz::tradata::ReaderFail , pwiz::proteome::ReaderFail
• readFile() : pwiz::msdata::mz5::Connection_mz5
• readIds() : pwiz::msdata::Reader , pwiz::msdata::ReaderList , pwiz::msdata::Reader_ABI , pwiz::msdata::ReaderList
• readSourceFiles() : pwiz::eharmony::Matcher
• readTrialData() : pwiz::calibration::CalibratorTrial::Configuration
• real() : pwiz::math::Random
• rebin() : pwiz::Bin< T >
• recalculate() : pwiz::calibration::MassSpread , pwiz::analysis::PrecursorRecalculatorDefault , pwiz::analysis::PrecursorRecalculator
• record() : pwiz::utility::MSIHandler , pwiz::analysis::PepxmlRecordReader::record , pwiz::peptideid::PeptideID
• Record() : pwiz::proteome::IPIFASTADatabase::Record
• record() : pwiz::peptideid::PeptideID_pepXml , pwiz::peptideid::PeptideIDMap
• Record() : pwiz::peptideid::PeptideID::Record , pwiz::utility::MSIHandler::Record
• record() : pwiz::peptideid::PeptideID_flat
• records() : pwiz::proteome::PeptideDatabase , pwiz::proteome::IPIFASTADatabase
• recreate() : pwiz::msdata::Index_mzML
• rectangle() : pwiz::util::Image
• ReferenceRead_mz5() : pwiz::msdata::mz5::ReferenceRead_mz5
• ReferenceWrite_mz5() : pwiz::msdata::mz5::ReferenceWrite_mz5
• RefineMassVal() : pwiz::analysis::SpectrumList_PrecursorRefine
• RefListMZ5() : pwiz::msdata::mz5::RefListMZ5
• RefMZ5() : pwiz::msdata::mz5::RefMZ5
• RegexCVMap() : pwiz::identdata::RegexCVMap
• RegionAnalyzer() : pwiz::analysis::RegionAnalyzer
• RegionSIC() : pwiz::analysis::RegionSIC
• RegionSlice() : pwiz::analysis::RegionSlice
• RegionTIC() : pwiz::analysis::RegionTIC
• remove() : pwiz::analysis::MZRTField< T >
• remove_zeros() : pwiz::analysis::ExtraZeroSamplesFilter
• removeListener() : pwiz::util::IterationListenerRegistry
• rend() : pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::util::virtual_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc > , pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor > , auto_vector< T > , pwiz::proteome::ModificationMap , pwiz::util::mru_list< Item, KeyExtractor > , pwiz::util::shared_map< keyT, valueT, _Pr, _Alloc >
• ReportHash() : CSHA1
• ReportHashStl() : CSHA1
• reserve() : auto_vector< T >
• Reset() : CSHA1
• reset() : pwiz::util::SHA1Calculator
• Residue() : pwiz::identdata::Residue
• resize() : auto_vector< T > , pwiz::minimxml::SAXParser::saxstring
• results() : pwiz::calibration::CalibratorTrial
• retentionTime() : pwiz::data::FrequencyData
• retentionTimeMax() : pwiz::data::peakdata::Peakel , pwiz::data::peakdata::Feature , Simple , Goober
• retentionTimeMin() : pwiz::data::peakdata::Peakel , pwiz::data::peakdata::Feature , Goober , Simple
• reverseTranslate() : pwiz::msdata::mz5::Translator_mz5
• reverseTranslateIntensity() : pwiz::msdata::mz5::Translator_mz5
• reverseTranslateMZ() : pwiz::msdata::mz5::Translator_mz5
• Revision() : pwiz::Version , pwiz::tradata::Version , pwiz::identdata::Version , pwiz::msdata::Version , pwiz::analysis::Version , pwiz::proteome::Version
• RootHandler() : RootHandler
• RTMatches_Contains() : pwiz::analysis::RTMatches_Contains< T >
• RTMatches_IsContainedIn() : pwiz::analysis::RTMatches_IsContainedIn< T >
• Run() : pwiz::msdata::Run
• run() : pwiz::calibration::CalibratorTrial
• Run() : pwiz::msdata::Run
• RunMZ5() : pwiz::msdata::mz5::RunMZ5
• RunSummary() : pwiz::analysis::RunSummary