- a -

• AnalysisSummaryPtr : pwiz::data::pepxml

- b -

• BinaryDataArrayPtr : pwiz::msdata

- c -

• charcounter : pwiz::minimxml
• ChromatogramDataFilterPtr : pwiz::analysis
• ChromatogramListPtr : pwiz::msdata
• ChromatogramListSimplePtr : pwiz::msdata
• ChromatogramPtr : pwiz::msdata
• CompoundPtr : pwiz::tradata
• ContactPtr : pwiz::tradata
• CVMapPtr : pwiz::identdata

- d -

• DataFilterPtr : pwiz::data::pepxml
• DataProcessingPtr : pwiz::msdata
• DatasetDerivationPtr : pwiz::data::pepxml
• DfcPtr : pwiz::eharmony
• dmatrix : pwiz::math::types
• dvector : pwiz::math::types
• DxCD : pwiz::math::MatchedFilter
• DxD : pwiz::math::MatchedFilter

- e -

• Entry : pwiz::eharmony

- f -

• FdfPtr : pwiz::eharmony
• FeatureField : pwiz::analysis
• FeaturePtr : pwiz::data::peakdata
• FeatureSequencedPtr : pwiz::eharmony
• FrequencyDatum : pwiz::data

- i -

• IdentDataPtr : pwiz::identdata
• Index_mzML_Ptr : pwiz::msdata
• IndexPtr : pwiz::data
• InstrumentConfigurationPtr : pwiz::msdata
• InstrumentPtr : pwiz::tradata
• IterationListenerPtr : pwiz::util

- m -

• MassDistribution : pwiz::chemistry
• MatchPtr : pwiz::data::pepxml
• MSDataAnalyzerPtr : pwiz::analysis
• MSDataPtr : pwiz::msdata

- p -

• ParameterPtr : pwiz::data::pepxml
• ParamGroupPtr : pwiz::data
• PeakDetectorPtr : pwiz::analysis
• PeakelField : pwiz::analysis
• PeakelPtr : pwiz::data::peakdata
• PeptideMatchContainer : pwiz::eharmony
• PeptidePtr : pwiz::tradata
• PidfPtr : pwiz::eharmony
• ProcessingMethodPtr : pwiz::msdata
• ProteinListPtr : pwiz::proteome
• ProteinPtr : pwiz::tradata , pwiz::proteome

- r -

• random_access_compressed_ifstream_off_t : pwiz::util
• ReaderPtr : pwiz::identdata , pwiz::tradata , pwiz::proteome , pwiz::msdata
• RegexCVMapPtr : pwiz::identdata

- s -

• SamplePtr : pwiz::msdata
• ScanSettingsPtr : pwiz::msdata
• SearchHitPtr : pwiz::data::pepxml
• SearchResultPtr : pwiz::data::pepxml
• SearchScorePtr : pwiz::data::pepxml
• SearchSummaryPtr : pwiz::data::pepxml
• SmootherPtr : pwiz::analysis
• SoftwarePtr : pwiz::msdata , pwiz::tradata
• SourceFilePtr : pwiz::msdata
• SpectrumDataFilterPtr : pwiz::analysis
• SpectrumListPtr : pwiz::msdata
• SpectrumListSimplePtr : pwiz::msdata
• SpectrumPtr : pwiz::msdata
• SpectrumQueryPtr : pwiz::eharmony , pwiz::data::pepxml

- t -

• TraDataPtr : pwiz::tradata
• Type : pwiz::chemistry::detail

- w -

• wcharcounter : pwiz::minimxml